针对流域水环境复合污染、水生态系统退化、水环境安全难以保障等问题，以流域水生态环境系统调控与综合管理理念创新为突破口，流域水质目标管理、污染物输迁与水质演变规律等研究为基础，重点研究流域污染分类分区控制、富营养化过程与防控、污染水体修复与生态健康重建等关键技术，构建流域水环境综合治理与水生态安全技术体系，为全面改善流域水环境质量、保障水环境水生态安全提供科技支撑和政府科学决策依据。